遅レスですいません。
私の環境では、2つの育成器でほぼ同時に開始してもたいてい約30分ズレてます。
ワープ後などに見直すと妥当な数値に変わっていることが多いので表示だけの
問題なんだろうと思っていました。
バグだらけなので表示だけの問題じゃ報告しても修正されないだろうなと。

が、先ほどやはりほぼ同時に開始した片方の完了後、もう片方の残り1～2分の
カウントダウンの間にデュエルをして戻ってきたら、残り約30分に増えてました。
片方は完了済みで空なので、表示だけのバグではなかったみたいです。