Quest：メイン、サブ、物語
Mission：イベント、○○を倒そう
などがありますが、クエストとミッションは上限は別々にされていたと思います。
不具合ではないので、質問掲示板に書いたほうがいいかと思います。
ギルドに所属しているのなら、強敵を倒すミッションなどは手伝ってもらってクリアする事で減るかもしれません。
サブクエストも多くは手伝ってもらえるものが多いので今一度確認をしてみてください。

まったく同じ状態です。BP１６０００程。ゲッシーの村を出たあたりですぐ「ミッションの受注は行えませんでした」の表示がでます。 物語のミッションを取り消せたらいいのにと思います。

ゲッシーストーリーは上級マップなので30000BP以上でかつPTじゃないとクリアーは難しいです。他のストーリーをこなすのが良いと思います。

湯水のように課金可能であればとりあえずガチャを100連ほどするといくらか強くはなります。
それでもソロではクリアーは難しいのがゲッシーストーリーだと思います。

抱えてるサブクエストを取り消すという方法も。
＊サンプル画像は拾い物です。

クエスト一覧のサブと書かれた掲示板アイコンを押すとクエスト詳細が開きます。
クエスト詳細画面の右下にある、「受注取消」というボタンを押すと、そのクエストが
取り消せます。

＊
メインクエストや、ヒーローのストーリークエストは「受注取消」ボタンが出ません。