今もまだできない状態でしょうか？
自分もこないだのアプデ以降Win7のＩＥでクレジット課金できなくなってしまったのですが、同症状の他の方の対処法で解決しました。
『Google Chrome』ブラウザをインストールしWindowsコンパネから『Google Chrome』を『既定のプログラム』にする事で回避できました。
『お金のやり取りはＩＥしか使わないので』という事ですので、あまり参考にはなりませんかもしれませんが。

コメントありがとうございます。
どうしても課金したくなったら、ほかの閲覧ソフト（Chromeなど）を試して見ます。