放置するしかないかもです～
私もうっとおしいけど我慢してます

やはり無視するしか無いんですね
残念です。

声を上げなければ運営は動きません
不具合報告か要望で送ろう
重大な不具合、要望の多いもの、長期なもの、PCのみでなくスマホでもあるもの等が優先されるが何人も同じ症状で困ってるって分かれば対処してくれる。はず

今のところ、通知機能が表示されないようにすることは、できない仕様のようですね。
このマーク表示もそうですが、それ以上に進化のつもりでいたら(いつの間にか)ズレていることがあり、うっかり限界突破してしまうことがあったという話をきくことが何度かありました。注意が必要な部分のようです。

できれば、ヘルプなどはゲーム開始時に押すようにしていますが、ギルド加入しフレンド増加すると常に点灯するので、
途中では余力がある時押すか、終了前に再度ヘルプ押すようにしています。(。・_・。)ノ
逆に、ギルド点灯では、ヘルプもアイテム依頼でも点灯するので、アイテム依頼に気づかない場合もあります。
ギルド掲示板は、内装に出現するヒーローアニマ獲得の前後に、ゲーム途中で確認するようにしています。(。・_・。)ノ

報酬系の表示では、レイドの報酬ゲージがデイリーなどの更に下の方に隠れて、気づきにくいなど改善されると良いなあというものもあります。その他→レイド→今日または昨日の所から、報酬で獲得することもできます。